生物信息学:简介虚拟实验室

这个模拟取代了之前的“植物转录组学”模拟。

如果你能设计出一种从稀有植物到另一种生物体的代谢途径，并大规模生产一种抗疟化合物，那会怎样?在这个模拟中，你将学习如何识别编码特定酶的基因。你将使用一种叫做RNA-seq的方法来量化不同基因的转录。利用这些信息，利用生物信息学工具缩小候选基因的范围。

找到一种新的抗疟疾化合物

你的任务从分析亚马逊雨林的植物样本开始。一群当地部落的人用这种稀有的植物来治疗疟疾。一位植物化学家鉴定了这种抗疟化合物。你们的任务是找出产生这种潜在药物的酶。

了解分子化合物是如何产生的，并提取RNA

你们的下一个任务将是确定一种将前体分子转化为抗疟疾成分的酶途径。如果你想大量生产这种化合物，你需要将酶的途径转化成另一种有机体。要做到这一点，你必须识别编码酶的基因。你所需要的所有信息都包含在不同植物组织中mRNA分子的组成中。

了解mRNA和DNA的结构差异，进行RNA-seq

mRNA和DNA功能的关键是它们的结构。当实验室助理将你的信使rna样本反向转录为cDNA时，你将学习这两个惊人分子的结构。然后，您的下一个任务是执行下一代测序(NGS)的cDNA样本。你将对不同植物组织的cDNA进行测序，以确定目标酶的序列和表达。动画将向您展示流单元内部正在发生什么，使您能够看到数百万个不同序列可以并行读取。

使用系统发育分析和BLAST分析结果

像一个真正的侦探一样，你将分析大量的NGS读取，并确定哪一种酶最有可能参与抗疟化合物的生物合成。您将学习如何利用DNA序列的相关性来识别未知的酶，并学习序列比较的基础知识。

你能识别出这种酶并生产出一种能拯救数百万人的新药吗?