下一代测序虚拟实验室

在下一代测序(NGS)模拟中，您将获得来自格陵兰岛一位古代男子的头发样本，提取他的DNA，并进行DNA测序。NGS技术使用第二代DNA测序，用户同时对多个样本进行测序，也被称为大规模平行测序。NGS有许多现实生活中的应用场景。在这个实验室中，您将使用SNP(单核苷酸多态性)分析，以关联结果与物理外观，如脱发，耳垢厚度和许多其他。通过观察SNP的结果，你将学会如何重建格陵兰岛古人的外貌。

了解从DNA到测序结果的步骤

在Next Generation测序实验室的第一部分，您将经历样品制备和测序流程的多个步骤，了解样品的片段化、末端修复、a -tail和PCR扩增。然后，您将进入测序机，在那里执行集群生成，然后进行测序反应和数据收集。这些过程将与3D动画以及测试问题说明。

数据处理与分析

在完成排序过程之后，您将获得作为FASTQ文件的数据结果。你的下一个任务就是处理它们。使用命令行，您将了解如何对数据执行质量控制、消除退化和污染的DNA、裁剪适配器、将序列映射到参考基因组，并执行SNP分析。通过比较SNP图谱，你可以研究迁移模式。你也可以观察特定的snp，例如，那些导致氨基酸变化并导致特定物理特征如脱发或耳垢厚度的snp。请注意，本实验室所呈现的数据处理与分析，可适用于其他适用于不同课程的数据分析工具。

学习所有关于排序的知识

下一代测序实验室强调样品制备和测序程序-无论下游应用的不同都是不变的。通过虚拟实验室，您将彻底了解获取DNA样本的多阶段过程，并能够使用该过程来找到测序结果并执行分析。