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关于下一代测序虚拟实验室仿真

在下一代测序(NGS)模拟中,您将获得来自格陵兰岛一位古代男子的头发样本,提取他的DNA,并进行DNA测序。NGS技术使用第二代DNA测序,用户同时对多个样本进行测序,也被称为大规模平行测序。NGS有许多现实生活中的应用场景。在这个实验室中,您将使用SNP(单核苷酸多态性)分析,以关联结果与物理外观,如脱发,耳垢厚度和许多其他。通过观察SNP的结果,你将学会如何重建格陵兰岛古人的外貌。

了解从DNA到测序结果的步骤

在Next Generation测序实验室的第一部分,您将经历样品制备和测序流程的多个步骤,了解样品的片段化、末端修复、a -tail和PCR扩增。然后,您将进入测序机,在那里执行集群生成,然后进行测序反应和数据收集。这些过程将与3D动画以及测试问题说明。

数据处理与分析

在完成排序过程之后,您将获得作为FASTQ文件的数据结果。你的下一个任务就是处理它们。使用命令行,您将了解如何对数据执行质量控制、消除退化和污染的DNA、裁剪适配器、将序列映射到参考基因组,并执行SNP分析。通过比较SNP图谱,你可以研究迁移模式。你也可以观察特定的snp,例如,那些导致氨基酸变化并导致特定物理特征如脱发或耳垢厚度的snp。请注意,本实验室所呈现的数据处理与分析,可适用于其他适用于不同课程的数据分析工具。

学习所有关于排序的知识

下一代测序实验室强调样品制备和测序程序-无论下游应用的不同都是不变的。通过虚拟实验室,您将彻底了解获取DNA样本的多阶段过程,并能够使用该过程来找到测序结果并执行分析。

现在开始

学习使用新一代测序技术进行样品制备、测序、数据收集和数据分析的不同步骤。

技术在实验室

  • 新一代测序

学习目标

在这次模拟结束后,你将能够…

  • 了解样品制备、聚类生成、测序和数据处理的不同步骤
  • 了解古代DNA的特征
  • 理解单核苷酸多态性(SNP)可以与特定的物理特征紧密相关

模拟功能

长度- 48分钟
可访问性模式——可用
语言-英语、法语、德语、西班牙语、意大利语

相关标准的例子

大学

生命科学及遗传学相关课程二至三年级起

总会在

没有直接对齐

IB

没有直接对齐

美联社

没有直接对齐

下一代测序的截图虚拟实验室仿真

合作者

西蒙·拉斯穆森博士

西蒙·拉斯穆森博士

系统生物系生物序列分析中心
丹麦工业大学

它是如何工作的

在你的浏览器里有一个百万美元的实验室

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通过访问我们的模拟,您将有数百小时的参华体会赞助ac米兰与,高质量的学习内容提供给您。

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